联 系 人:吉恩特客服
手 机:136-0866-9917(微信同号)
地 址:河南省洛阳市高新区火炬创业园
华大基因依托BGISEQ-500平台强大的测序实力,推出性价比超高的表观组学研究利器ATAC-Seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin using Sequencing)。该技术通过改造后活性极高的转座酶介导,对染色质结构开放区域进行捕获测序,仅需少量细胞便可获得实时全基因组活性调控序列信息,广泛应用于转录因子结合分析、核小体定位、活性调控元件分布等研究,在表观遗传机制研究领域有广阔的应用前景。
技术优势
快速 实验流程精简,交付周期更短
微量 所需细胞量少(低至数百个细胞),适用于临床样本
准确 技术重复性好,与同类技术及同类测序平台一致性高
*** 获得信息量大(全基因组调控活性图谱、全转录因子结合图谱)
超值 依托华大基因BGISEQ-500平台强大的测序实力,超高性价比
研究内容
标准信息分析
标准信息分析:
1) 数据基本处理与质控
2) 文库插入片段长度分布
3) 基因组测序深度累积分布
4) 各样品基因promoter(up2K)区测序深度分布
5) Peak检测
6) Peak长度分布
7) Peak深度分布
8) 样本生物学重复 IDR 分析
9) Peak在基因功能元件上的分布
10) Peak相关基因
11) Peak相关基因的GO功能显著性富集分析
12) Peak相关基因的pathway富集分析
13) 样本间差异peak检测
14) 样品间差异peak在基因功能元件的分布
15) 样品间差异peak相关基因
16) 样品间差异peak相关基因的GO和KEGG富集分析
***信息分析:
17) 核小体定位分析
18) 转录因子结合分析(需客户提供感兴趣的TF名称)
19) 全基因组活性图谱
定制化信息分析
可结合客户的需求,协商确定定制化信息分析内容(如ATAC-Seq与RNA-Seq关联分析等)。
大量测序需要很大的核酸提取纯化实验量,磁珠法核酸提取纯化能够高通量自动化地进行测序前处理,且测序样本和其他核酸提取纯化样本的不同之处在于体系体积受限,需要用极小的体系体积完成一系列纯化处理过程。
G.N.T.公司生产的核酸提取磁珠能够很好地完成这一要求,未测序前处理带来***便捷可靠的产品体验。